From f4efdd93401485ce1ed63e7c34efbce4f6640964 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Paul-Christian Volkmer Date: Mon, 5 Oct 2026 12:35:04 +0200 Subject: docs: update README.md and ETL diagram (#325) Release-As: 0.18.0--- README.md | 27 ++++++++++++--------------- 1 file changed, 12 insertions(+), 15 deletions(-) (limited to 'README.md') diff --git a/README.md b/README.md index baeb55c..da43ff9 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -1,30 +1,27 @@ # ETL-Processor für das MV gem. §64e und DNPM:DIP [![Run Tests](https://github.com/pcvolkmer/etl-processor/actions/workflows/test.yml/badge.svg)](https://github.com/pcvolkmer/etl-processor/actions/workflows/test.yml) -Diese Anwendung pseudonymisiert/anonymisiert Daten im DNPM-Datenmodell 2.1 für das Modellvorhaben -Genomsequenzierung nach §64e unter Beachtung des Consents und sendet sie an DNPM:DIP. +ETL-Anwendung zur Pseudonymisierung von klinischen Daten für das Modellvorhaben Genomsequenzierung gem. §64e SGB V +im DNPM-Datenmodell 2.1 unter Beachtung des Consents. -## Einordnung innerhalb einer DNPM-ETL-Strecke +Pseudonymisierte und mit Consent versehene Daten können sowohl an DNPM:DIP als auch an nNGM weitergeleitet werden. +Eine Differenzierung anhand der Erkrankung und ICD10-Code ist dabei möglich. +So können zum Beispiel alle Lungenfälle an nNGM, sonstige Fällen an DNPM:DIP weitergeleitet werden. -Diese Anwendung erlaubt das Entgegennehmen von HTTP/REST-Anfragen aus dem Onkostar-Plugin -**[mv64e-onkostar-plugin-export](https://github.com/pcvolkmer/mv64e-onkostar-plugin-export)**. - -Der Inhalt einer Anfrage, wenn ein MTB-File, wird pseudonymisiert und auf Duplikate geprüft. -Duplikate werden verworfen, Änderungen werden weitergeleitet. - -Löschanfragen werden immer als Löschanfrage an DNPM:DIP weitergeleitet. +Zur Pseudonymgenerierung und Consentverwaltung werden die [Greifswalder Tools gPAS und gICS](https://www.ths-greifswald.de/) +unterstützt. -Zudem ist eine minimalistische Weboberfläche integriert, die einen Einblick in den aktuellen Zustand der Anwendung gewährt. +Diese Anwendung erlaubt das Entgegennehmen von Datensetzen im DNPM-Datenmodell 2.1 aus dem Onkostar-Plugin +**[mv64e-onkostar-plugin-export](https://github.com/pcvolkmer/mv64e-onkostar-plugin-export)**. ![Modell DNPM-ETL-Strecke](docs/etl.png) +## Wichtige Änderungen in den letzten Versionen + ### 🔥 Wichtige Änderungen in Version 0.18 Ab Version 0.18 kann diese Anwendung zur Datenausleitung über die nNGM-REST-API verwendet werden. -Dazu ist eine Konfiguration des in dieser Version eingeführten [Routing-Mechanismus](#routed-rest) erforderlich - -Hier wird jeder `PatientRecord`, dessen (letzte) Diagnose einen ICD-10-Code beginnend mit `C34` und beliebiger Endung hat, -nicht über den Standard-Weg versendet, sondern an den für nNGM konfigurierten API-Endpunkt. +Dazu kann auch die Konfiguration des in dieser Version eingeführten [Routing-Mechanismus](#routed-rest) verwendet werden. ### 🔥 Wichtige Änderungen in Version 0.17 -- cgit v1.2.3