Extraktion des Mappings Prozedur zu Prozedurwerten und Auswahl des Mappers

Aktuell sind nur die beiden Formulare

* OS.Systemische Therapie
* OS.Systemische Therapie.VarianteUKW

bekannt. Beide lassen sich über den extrahierten Mapper in eine Map mit
Prozedurwerten mappen.

6 files changed, 231 insertions, 67 deletions

diff --git a/src/main/java/DNPM/DNPMHelper.java b/src/main/java/DNPM/DNPMHelper.java
index 05d43db..2a7307f 100644
--- a/src/main/java/DNPM/DNPMHelper.java
+++ b/src/main/java/DNPM/DNPMHelper.java
@@ -1,6 +1,6 @@
 package DNPM;
 
-import ATCCodes.AtcCode;
+import DNPM.services.systemtherapie.SystemtherapieService;
 import com.fasterxml.jackson.core.JsonProcessingException;
 import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper;
 import de.itc.onkostar.api.Disease;
@@ -18,7 +18,10 @@ import org.hibernate.type.StandardBasicTypes;
 import org.slf4j.Logger;
 import org.slf4j.LoggerFactory;
 
-import java.util.*;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.HashMap;
+import java.util.List;
+import java.util.Map;
 
 public class DNPMHelper implements IProcedureAnalyzer {
 
@@ -26,8 +29,11 @@ public class DNPMHelper implements IProcedureAnalyzer {
 
     private final IOnkostarApi onkostarApi;
 
-    public DNPMHelper(final IOnkostarApi onkostarApi) {
+    private final SystemtherapieService systemtherapieService;
+
+    public DNPMHelper(final IOnkostarApi onkostarApi, final SystemtherapieService systemtherapieService) {
         this.onkostarApi = onkostarApi;
+        this.systemtherapieService = systemtherapieService;
     }
 
     @Override
@@ -144,70 +150,7 @@ public class DNPMHelper implements IProcedureAnalyzer {
             return null;
         }
 
-        List<Map<String, String>> result = new ArrayList<>();
-        for (Procedure Prozedur : onkostarApi.getProceduresForDiseaseByForm(Integer.parseInt(diagnoseId.toString()), "OS.Systemische Therapie")) {
-            result.add(getProzedurwerte(Prozedur));
-        }
-        return result;
-    }
-
-    private static Map<String, String> getProzedurwerte(Procedure Prozedur) {
-        List<String> wirkstoffListe = new ArrayList<>();
-        // SubstanzenCodesListe enthält die Liste der SubstanzenCodes
-        List<Map<String, String>> substanzenCodesListe = new ArrayList<>();
-
-        // alle Werte der Prozedur auslesen
-        Map<String, Item> alleWerte = Prozedur.getAllValues();
-        // Prozedurwerte enthält nur die interessanten Werte
-        Map<String, String> prozedurwerte = new HashMap<>();
-        // alle Werte durchgehen und die interessanten übernehmen
-        if (alleWerte.containsKey("Beendigung")) {
-            prozedurwerte.put("Beendigung", alleWerte.get("Beendigung").getValue());
-        }
-        if (alleWerte.containsKey("Ergebnis")) {
-            prozedurwerte.put("Ergebnis", alleWerte.get("Ergebnis").getValue());
-        }
-        if (alleWerte.containsKey("Beginn")) {
-            prozedurwerte.put("Beginn", alleWerte.get("Beginn").getString());
-        }
-        if (alleWerte.containsKey("Ende")) {
-            prozedurwerte.put("Ende", alleWerte.get("Ende").getString());
-        }
-        if (alleWerte.containsKey("SubstanzenList")) {
-            List<Map<String, String>> substanzList = alleWerte.get("SubstanzenList").getValue();
-            for (var substanz : substanzList) {
-                var substanzCodes = getSubstanzCode(substanz);
-                substanzenCodesListe.add(substanzCodes);
-                wirkstoffListe.add(substanzCodes.get("substance"));
-            }
-        }
-
-        prozedurwerte.put("Wirkstoffe", String.join(", ", wirkstoffListe));
-        try {
-            ObjectMapper mapper = new ObjectMapper();
-            prozedurwerte.put("WirkstoffCodes", mapper.writeValueAsString(substanzenCodesListe));
-        } catch (JsonProcessingException e) {
-            logger.error("Kann 'WirkstoffCodes' nicht in JSON-String mappen", e);
-        }
-
-        return prozedurwerte;
-    }
-
-    private static Map<String, String> getSubstanzCode(Map<String, String> substanz) {
-        Map<String, String> substanzCode = new HashMap<>();
-        if (substanz.containsKey("Substanz")) {
-            if (AtcCode.isAtcCode(substanz.get("Substanz"))) {
-                substanzCode.put("system", "ATC");
-            } else {
-                substanzCode.put("system", "other");
-            }
-            substanzCode.put("code", substanz.get("Substanz"));
-
-        }
-        if (substanz.containsKey("Substanz_shortDescription")) {
-            substanzCode.put("substance", substanz.get("Substanz_shortDescription"));
-        }
-        return substanzCode;
+        return systemtherapieService.getSystemischeTherapienFromDiagnose(Integer.parseInt(diagnoseId.toString()));
     }
 
     public Object getProzedurenFromDiagnose(final Map<String, Object> input) {
diff --git a/src/main/java/DNPM/config/PluginConfiguration.java b/src/main/java/DNPM/config/PluginConfiguration.java
index 88f065b..09a5c50 100644
--- a/src/main/java/DNPM/config/PluginConfiguration.java
+++ b/src/main/java/DNPM/config/PluginConfiguration.java
@@ -4,6 +4,8 @@ import DNPM.database.SettingsRepository;
 import DNPM.services.*;
 import DNPM.services.mtb.DefaultMtbService;
 import DNPM.services.mtb.MtbService;
+import DNPM.services.systemtherapie.DefaultSystemtherapieService;
+import DNPM.services.systemtherapie.SystemtherapieService;
 import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi;
 import org.springframework.context.annotation.Bean;
 import org.springframework.context.annotation.ComponentScan;
@@ -43,6 +45,14 @@ public class PluginConfiguration {
     }
 
     @Bean
+    public SystemtherapieService systemtherapieService(
+            final IOnkostarApi onkostarApi,
+            final SettingsService settingsService
+    ) {
+        return new DefaultSystemtherapieService(onkostarApi, settingsService);
+    }
+
+    @Bean
     public TherapieplanServiceFactory therapieplanServiceFactory(
             final IOnkostarApi onkostarApi,
             final SettingsService settingsService,
diff --git a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/DefaultSystemtherapieService.java b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/DefaultSystemtherapieService.java
new file mode 100644
index 0000000..9fb3149
--- /dev/null
+++ b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/DefaultSystemtherapieService.java
@@ -0,0 +1,73 @@
+package DNPM.services.systemtherapie;
+
+import DNPM.services.SettingsService;
+import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi;
+import de.itc.onkostar.api.Procedure;
+import org.slf4j.Logger;
+import org.slf4j.LoggerFactory;
+
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.List;
+import java.util.Map;
+
+/**
+ * Standardimplementierung des Systemtherapieservices
+ *
+ * @since 0.2.0
+ */
+public class DefaultSystemtherapieService implements SystemtherapieService {
+
+    private static final Logger logger = LoggerFactory.getLogger(DefaultSystemtherapieService.class);
+
+    private final IOnkostarApi onkostarApi;
+
+    private final SettingsService settingsService;
+
+    public DefaultSystemtherapieService(final IOnkostarApi onkostarApi, final SettingsService settingsService) {
+        this.onkostarApi = onkostarApi;
+        this.settingsService = settingsService;
+    }
+
+    /**
+     * Ermittelt eine Zusammenfassung der systemischen Therapien für eine Erkrankung
+     *
+     * @param diseaseId Die ID der Erkrankung
+     * @return Zusammenfassung der systemischen Therapien
+     */
+    @Override
+    public List<Map<String, String>> getSystemischeTherapienFromDiagnose(int diseaseId) {
+        var sid = this.settingsService.getSID();
+        if (sid.isEmpty()) {
+            logger.error("Kann SID nicht ermitteln um Formularnamen zu erhalten. Gebe 'null' zurück.");
+            return null;
+        }
+        List<Map<String, String>> result = new ArrayList<>();
+        for (Procedure prozedur : onkostarApi.getProceduresForDiseaseByForm(diseaseId, selectFormNameBySID(sid.get()))) {
+            prozedurToProzedurwerteMapper(prozedur).apply(prozedur).ifPresent(result::add);
+        }
+        return result;
+    }
+
+    /**
+     * Übergibt aktuell immer den Mapper für das Formular "OS.Systemische Therapie",
+     * da beide bekannte Varianten damit gemappt werden können.
+     *
+     * @param procedure Die Prozedur für die ein Mapper erstellt werden soll
+     * @return Der Mapper für die Prozedur
+     */
+    @Override
+    public ProzedurToProzedurwerteMapper prozedurToProzedurwerteMapper(Procedure procedure) {
+        return new OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper();
+    }
+
+    @Override
+    public String selectFormNameBySID(String sid) {
+        switch (sid) {
+            case "2011":
+            case "20119":
+                return "OS.Systemische Therapie.VarianteUKW";
+            default:
+                return "OS.Systemische Therapie";
+        }
+    }
+}
diff --git a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper.java b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper.java
new file mode 100644
index 0000000..eb6371b
--- /dev/null
+++ b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper.java
@@ -0,0 +1,90 @@
+package DNPM.services.systemtherapie;
+
+import ATCCodes.AtcCode;
+import com.fasterxml.jackson.core.JsonProcessingException;
+import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper;
+import de.itc.onkostar.api.Item;
+import de.itc.onkostar.api.Procedure;
+import org.slf4j.Logger;
+import org.slf4j.LoggerFactory;
+
+import java.util.*;
+
+/**
+ * Implementierung zum Mappen des Formulars "OS.Systemische Therapie" auf die Prozedurwerte
+ *
+ * @since 0.2.0
+ */
+public class OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper implements ProzedurToProzedurwerteMapper {
+
+    private static final Logger logger = LoggerFactory.getLogger(OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper.class);
+
+    @Override
+    public Optional<Map<String, String>> apply(Procedure procedure) {
+        try {
+            return Optional.of(getProzedurwerte(procedure));
+        } catch (Exception e) {
+            logger.error("Fehler beim Mappen der Prozedur auf Prozedurwerte", e);
+            return Optional.empty();
+        }
+    }
+
+    private static Map<String, String> getProzedurwerte(Procedure Prozedur) {
+        List<String> wirkstoffListe = new ArrayList<>();
+        // SubstanzenCodesListe enthält die Liste der SubstanzenCodes
+        List<Map<String, String>> substanzenCodesListe = new ArrayList<>();
+
+        // alle Werte der Prozedur auslesen
+        Map<String, Item> alleWerte = Prozedur.getAllValues();
+        // Prozedurwerte enthält nur die interessanten Werte
+        Map<String, String> prozedurwerte = new HashMap<>();
+        // alle Werte durchgehen und die interessanten übernehmen
+        if (alleWerte.containsKey("Beendigung")) {
+            prozedurwerte.put("Beendigung", alleWerte.get("Beendigung").getValue());
+        }
+        if (alleWerte.containsKey("Ergebnis")) {
+            prozedurwerte.put("Ergebnis", alleWerte.get("Ergebnis").getValue());
+        }
+        if (alleWerte.containsKey("Beginn")) {
+            prozedurwerte.put("Beginn", alleWerte.get("Beginn").getString());
+        }
+        if (alleWerte.containsKey("Ende")) {
+            prozedurwerte.put("Ende", alleWerte.get("Ende").getString());
+        }
+        if (alleWerte.containsKey("SubstanzenList")) {
+            List<Map<String, String>> substanzList = alleWerte.get("SubstanzenList").getValue();
+            for (var substanz : substanzList) {
+                var substanzCodes = getSubstanzCode(substanz);
+                substanzenCodesListe.add(substanzCodes);
+                wirkstoffListe.add(substanzCodes.get("substance"));
+            }
+        }
+
+        prozedurwerte.put("Wirkstoffe", String.join(", ", wirkstoffListe));
+        try {
+            ObjectMapper mapper = new ObjectMapper();
+            prozedurwerte.put("WirkstoffCodes", mapper.writeValueAsString(substanzenCodesListe));
+        } catch (JsonProcessingException e) {
+            logger.error("Kann 'WirkstoffCodes' nicht in JSON-String mappen", e);
+        }
+
+        return prozedurwerte;
+    }
+
+    private static Map<String, String> getSubstanzCode(Map<String, String> substanz) {
+        Map<String, String> substanzCode = new HashMap<>();
+        if (substanz.containsKey("Substanz")) {
+            if (AtcCode.isAtcCode(substanz.get("Substanz"))) {
+                substanzCode.put("system", "ATC");
+            } else {
+                substanzCode.put("system", "other");
+            }
+            substanzCode.put("code", substanz.get("Substanz"));
+
+        }
+        if (substanz.containsKey("Substanz_shortDescription")) {
+            substanzCode.put("substance", substanz.get("Substanz_shortDescription"));
+        }
+        return substanzCode;
+    }
+}
diff --git a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/ProzedurToProzedurwerteMapper.java b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/ProzedurToProzedurwerteMapper.java
new file mode 100644
index 0000000..f205554
--- /dev/null
+++ b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/ProzedurToProzedurwerteMapper.java
@@ -0,0 +1,14 @@
+package DNPM.services.systemtherapie;
+
+import de.itc.onkostar.api.Procedure;
+
+import java.util.Map;
+import java.util.Optional;
+import java.util.function.Function;
+
+/**
+ * Mapper um ein Systemtherapieformular in eine Optional-Map mit Prozedurwerten umzuwandeln
+ *
+ * @since 0.2.0
+ */
+public interface ProzedurToProzedurwerteMapper extends Function<Procedure, Optional<Map<String, String>>> {}
diff --git a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/SystemtherapieService.java b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/SystemtherapieService.java
new file mode 100644
index 0000000..6b11c76
--- /dev/null
+++ b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/SystemtherapieService.java
@@ -0,0 +1,34 @@
+package DNPM.services.systemtherapie;
+
+import de.itc.onkostar.api.Procedure;
+
+import java.util.List;
+import java.util.Map;
+
+/**
+ * Service für Systemtherapieformulare
+ *
+ *  @since 0.2.0
+ */
+public interface SystemtherapieService {
+    /**
+     * Ermittelt eine Zusammenfassung der systemischen Therapien für eine Erkrankung
+     * @param diseaseId Die ID der Erkrankung
+     * @return Die Zusammenfassung der systemischen Therapien
+     */
+    List<Map<String, String>> getSystemischeTherapienFromDiagnose(int diseaseId);
+
+    /**
+     * Erstellt den Mapper for die Prozedur
+     * @param procedure Die Prozedur für die ein Mapper erstellt werden soll
+     * @return Der erstellte ProzedurToProzedurwerteMapper
+     */
+    ProzedurToProzedurwerteMapper prozedurToProzedurwerteMapper(Procedure procedure);
+
+    /**
+     * Ermittelt den Formularnamen anhand der SID
+     * @param sid die SID
+     * @return Den ermittelten Formularnamen
+     */
+    String selectFormNameBySID(String sid);
+}