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diff --git a/sql/sql-queries.md b/sql/sql-queries.md deleted file mode 100644 index dcf7aa5..0000000 --- a/sql/sql-queries.md +++ /dev/null @@ -1,193 +0,0 @@ -# SQL-Queries für DNPM-Formulare - -## Abfrage von weiteren Informationen zu Merkmalskatalogeinträgen (Propcat) - -Angenommen eine Abfrage liefert für dk_molekulargenetik.entnahmemethode den Wert B und -die zugehörige Version in dk_molekulargenetik.entnahmemethode_propcat_version ist 1171: - -``` -SELECT code, shortdesc, description FROM property_catalogue_version_entry - WHERE code = 'B' - AND property_version_id = 1171 -``` - -Diese Abfrage liefert B, Biopsie, Biopsie. - -## Stammdaten zum Patienten anhand SAP-ID für den Personenstamm z.B. 4. - -``` -SELECT * FROM patient - WHERE patient.patienten_id = '?' AND patient.personenstamm = 4; -``` - -## Diagnosedaten zur Erkrankung - -``` -SELECT dk_diagnose.* FROM dk_diagnose - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_diagnose.id) - JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id) - JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id) - JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id) - WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?; -``` - -## Formular DNPM Klinik/Anamnese inkl. Unterformulare - -Formular DNPM Klinik/Anamnese anhand Patienten-(SAP)-ID und Onkostar-Tumor-ID: - -``` -SELECT dk_dnpm_kpa.* FROM dk_dnpm_kpa - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_kpa.id) - JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id) - JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id) - JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id) - WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?; -``` - -## Unterformular Histologie(en) - -``` -SELECT dk_dnpm_uf_histologie.* FROM dk_dnpm_uf_histologie - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_histologie.id) - WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?; -``` - -## Unterformular ECOG Performance Status Verlauf - -``` -SELECT dk_dnpm_uf_tumorausbreitung.* FROM dk_dnpm_uf_tumorausbreitung - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_tumorausbreitung.id) - WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?; -``` - -## Unterformular Tumorerkrankung bei Verwandten - -``` -SELECT dk_dnpm_uf_verwandte.* FROM dk_dnpm_uf_verwandte - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_verwandte.id) - WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?; -``` - -## Unterformular Molekularpathologische Vorbefunde - -``` -SELECT dk_dnpm_vorbefunde.* FROM dk_dnpm_vorbefunde - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_vorbefunde.id) - WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?; -``` - -## Unterformular Therapielinien - -Achtung: Hier enthält der Tabellenname nicht den Bestandteil 'uf' für Unterformular. - -``` -SELECT dk_dnpm_therapielinie.* FROM dk_dnpm_therapielinie - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_therapielinie.id) - WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?; -``` - -Im Feld wirkstoffcodes sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert, da -Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann: - -| Name | Bedeutung | -|-----------|-----------------------------------------| -| system | Das verwendete System. ATC oder "other" | -| code | Der verwendete Wirkstoffcode | -| substance | Der Name des Wirkstoffs | - -Beispiel: - -``` -[ - {"system":"other","code":"Gemcitabin","substance":"Gemcitabin (dFdC)"}, - {"system":"other","code":"Cisplatin ","substance":"Cisplatin (CDDP)"} -] -``` - -## Formular DNPM Therapieplan inkl. Unterformulare - -Formular DNPM Klinik/Anamnese anhand Patienten-(SAP)-ID und Onkostar-Tumor-ID: - -``` -SELECT dk_dnpm_therapieplan.* FROM dk_dnpm_therapieplan - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_therapieplan.id) - JOIN erkrankung_prozedur ON (erkrankung_prozedur.prozedur_id = prozedur.id) - JOIN erkrankung ON (erkrankung.id = erkrankung_prozedur.erkrankung_id) - JOIN patient ON (patient.id = prozedur.patient_id) - WHERE patient.patienten_id = '?' AND erkrankung.tumoridentifikator = ?; -``` - -Alternativ mit Verweis auf DNPM Klinik/Anamnese - -``` -... - WHERE dk_dnpm_therapieplan.ref_dnpm_klinikanamnese = ?; -``` - -### Unterformular Reevaluation - -``` -SELECT dk_dnpm_uf_reevaluation .* FROM dk_dnpm_uf_reevaluation - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_reevaluation .id) - WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?; -``` - -Achtung! Gegebenenfalls ist vor dem erneuten Bearbeiten des Formulars der Inhalt eines -einzelnen Reevaluationsauftrags direkt im Hauptformular gespeichert. In dem Fall sind keine -Unterformulare zur Reevaluation gespeichert. - -### Unterformular Rebiopsie - -``` -SELECT dk_dnpm_uf_rebiopsie.* FROM dk_dnpm_uf_rebiopsie - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_rebiopsie.id) - WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?; -``` - -### Unterformular Einzelempfehlung - -``` -SELECT dk_dnpm_uf_einzelempfehlung.* FROM dk_dnpm_uf_einzelempfehlung - JOIN prozedur ON (prozedur.id = dk_dnpm_uf_einzelempfehlung.id) - WHERE prozedur.hauptprozedur_id = ?; -``` - -#### Wirkstoffe - -Im Feld wirkstoffe_json sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert, da -Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann: - -| Name | Bedeutung | -|--------|--------------------------------------------------| -| system | Das verwendete System. "ATC" oder "UNREGISTERED" | -| code | Der verwendete Wirkstoffcode | -| name | Der Name des Wirkstoffs | - -Beispiel: - -``` -[ - {"code":"","name":"PARP-Inhibierung","system":"UNREGISTERED"} -] -``` - -#### Studien - -Im Feld studien_alle_json sind die Wirkstoffe als JSON-Array in folgender Form gespeichert, -da Onkostar keine Liste in Unterformularen verarbeiten kann: - -| Name | Bedeutung | -|-------------------------|-----------------------------| -| studie | Name der Studie | -| system | System der Studie(n-ID) | -| id (und alt auch "nct") | Die Studien-ID | -| ort | Ort der Studiendurchführung | -| internextern | intern (i) oder extern (e) | - -Beispiel: - -``` -[ - {"studie":"TestInhibitor","system":"NCT","id":"NCT12345678","nct":"NCT12345678","ort":"Teststadt","internextern":"e"} -] -``` |