From cc27edc544cec1b892e7c224aec9e6e42342aa39 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Paul-Christian Volkmer
Date: Sat, 21 Sep 2024 22:10:24 +0200
Subject: refactor: use package name following Java guidelines

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 .../DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java    | 134 ---------------------
 1 file changed, 134 deletions(-)
 delete mode 100644 src/main/java/DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java

(limited to 'src/main/java/DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java')

diff --git a/src/main/java/DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java b/src/main/java/DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java
deleted file mode 100644
index 1724272..0000000
--- a/src/main/java/DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java
+++ /dev/null
@@ -1,134 +0,0 @@
-package DNPM.analyzer;
-
-import DNPM.dto.Studie;
-import DNPM.dto.Variant;
-import DNPM.security.PermissionType;
-import DNPM.security.PersonPoolBasedPermissionEvaluator;
-import DNPM.services.StudienService;
-import DNPM.services.molekulargenetik.MolekulargenetikFormService;
-import de.itc.onkostar.api.Disease;
-import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi;
-import de.itc.onkostar.api.Procedure;
-import de.itc.onkostar.api.analysis.AnalyzerRequirement;
-import org.slf4j.Logger;
-import org.slf4j.LoggerFactory;
-import org.springframework.security.core.context.SecurityContextHolder;
-import org.springframework.stereotype.Component;
-
-import java.util.List;
-import java.util.Map;
-
-/**
- * Diese Klasse implementiert ein Plugin, welches Funktionen für DNPM UF Einzelempfehlung bereitstellt.
- *
- * @since 0.2.0
- */
-@Component
-public class EinzelempfehlungAnalyzer extends BackendService {
-
-    private final static Logger logger = LoggerFactory.getLogger(EinzelempfehlungAnalyzer.class);
-
-    private final IOnkostarApi onkostarApi;
-
-    private final MolekulargenetikFormService molekulargenetikFormService;
-
-    private final StudienService studienService;
-
-    private final PersonPoolBasedPermissionEvaluator permissionEvaluator;
-
-    public EinzelempfehlungAnalyzer(
-            final IOnkostarApi onkostarApi,
-            final StudienService studienService,
-            final MolekulargenetikFormService molekulargenetikFormService,
-            final PersonPoolBasedPermissionEvaluator permissionEvaluator
-    ) {
-        this.onkostarApi = onkostarApi;
-        this.studienService = studienService;
-        this.molekulargenetikFormService = molekulargenetikFormService;
-        this.permissionEvaluator = permissionEvaluator;
-    }
-
-    @Override
-    public String getDescription() {
-        return "Stellt Funktionen zur Nutzung im Therapieplan-Unterformular für Einzelempfehlungen bereit";
-    }
-
-    /**
-     * @deprecated
-     */
-    @Override
-    public boolean isRelevantForDeletedProcedure() {
-        return false;
-    }
-
-    @Override
-    public boolean isRelevantForAnalyzer(Procedure procedure, Disease disease) {
-        return false;
-    }
-
-    @Override
-    public boolean isSynchronous() {
-        return false;
-    }
-
-    @Override
-    public AnalyzerRequirement getRequirement() {
-        return AnalyzerRequirement.PROCEDURE;
-    }
-
-    public List<Variant> getVariants(Map<String, Object> input) {
-        var procedureId = AnalyzerUtils.getRequiredId(input, "id");
-
-        if (procedureId.isEmpty()) {
-            return List.of();
-        }
-
-        var procedure = onkostarApi.getProcedure(procedureId.get());
-        if (null == procedure) {
-            return List.of();
-        }
-
-        if (permissionEvaluator.hasPermission(SecurityContextHolder.getContext().getAuthentication(), procedure, PermissionType.READ)) {
-            return molekulargenetikFormService.getVariants(procedure);
-        } else {
-            logger.error("Security: No permission to access procedure '{}'", procedure.getId());
-            return List.of();
-        }
-    }
-
-    /**
-     * Übergibt alle Studien, deren (Kurz-)Beschreibung oder NCT-Nummer den übergebenen Eingabewert <code>q</code> enthält
-     *
-     * <p>Wurde der Eingabewert nicht angegeben oder ist leer, werden alle Studien übergeben.
-     *
-     * <p>Beispiel zur Nutzung in einem Formularscript
-     * <pre>
-     * executePluginMethod(
-     *   'TherapieplanAnalyzer',
-     *   'getStudien',
-     *   { q: 'NCT-12', inactive: true },
-     *   (response) => console.log(response),
-     *   false
-     * );
-     * </pre>
-     *
-     * @param input Map mit Eingabewerten
-     * @return Liste mit Studien
-     */
-    public List<Studie> getStudien(Map<String, Object> input) {
-        var query = AnalyzerUtils.getRequiredValue(input, "q", String.class);
-        var inactive = AnalyzerUtils.getRequiredValue(input, "inactive", Boolean.class).orElse(false);
-
-        if (query.isEmpty() || query.get().isBlank()) {
-            if (inactive) {
-                return studienService.findAll();
-            }
-            return studienService.findActive();
-        }
-        if (inactive) {
-            return studienService.findByQuery(query.get());
-        }
-        return studienService.findActiveByQuery(query.get());
-    }
-
-}
-- 
cgit v1.2.3