From fb91356b7777dfa5b6088bcc3a48b43924c1c0fd Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Paul-Christian Volkmer Date: Thu, 3 Sep 2026 14:35:10 +0200 Subject: build: apply Spotless plugin (#293) --- .../analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java | 195 +++++++++++---------- 1 file changed, 98 insertions(+), 97 deletions(-) (limited to 'src/main/java/dev/dnpm/oshelper/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java') diff --git a/src/main/java/dev/dnpm/oshelper/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java b/src/main/java/dev/dnpm/oshelper/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java index 941d3c8..12dc47a 100644 --- a/src/main/java/dev/dnpm/oshelper/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java +++ b/src/main/java/dev/dnpm/oshelper/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java @@ -19,135 +19,136 @@ package dev.dnpm.oshelper.analyzer; +import de.itc.onkostar.api.Disease; +import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi; +import de.itc.onkostar.api.Procedure; +import de.itc.onkostar.api.analysis.AnalyzerRequirement; import dev.dnpm.oshelper.dto.Studie; import dev.dnpm.oshelper.dto.Variant; import dev.dnpm.oshelper.security.PermissionType; import dev.dnpm.oshelper.security.PersonPoolBasedPermissionEvaluator; import dev.dnpm.oshelper.services.StudienService; import dev.dnpm.oshelper.services.molekulargenetik.MolekulargenetikFormService; -import de.itc.onkostar.api.Disease; -import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi; -import de.itc.onkostar.api.Procedure; -import de.itc.onkostar.api.analysis.AnalyzerRequirement; +import java.util.List; +import java.util.Map; import org.slf4j.Logger; import org.slf4j.LoggerFactory; import org.springframework.security.core.context.SecurityContextHolder; import org.springframework.stereotype.Component; -import java.util.List; -import java.util.Map; - /** - * Diese Klasse implementiert ein Plugin, welches Funktionen für DNPM UF Einzelempfehlung bereitstellt. + * Diese Klasse implementiert ein Plugin, welches Funktionen für DNPM UF Einzelempfehlung + * bereitstellt. * * @since 0.2.0 */ @Component public class EinzelempfehlungAnalyzer extends BackendService { - private final static Logger logger = LoggerFactory.getLogger(EinzelempfehlungAnalyzer.class); - - private final IOnkostarApi onkostarApi; - - private final MolekulargenetikFormService molekulargenetikFormService; + private static final Logger logger = LoggerFactory.getLogger(EinzelempfehlungAnalyzer.class); - private final StudienService studienService; + private final IOnkostarApi onkostarApi; - private final PersonPoolBasedPermissionEvaluator permissionEvaluator; + private final MolekulargenetikFormService molekulargenetikFormService; - public EinzelempfehlungAnalyzer( - final IOnkostarApi onkostarApi, - final StudienService studienService, - final MolekulargenetikFormService molekulargenetikFormService, - final PersonPoolBasedPermissionEvaluator permissionEvaluator - ) { - this.onkostarApi = onkostarApi; - this.studienService = studienService; - this.molekulargenetikFormService = molekulargenetikFormService; - this.permissionEvaluator = permissionEvaluator; - } + private final StudienService studienService; - @Override - public String getDescription() { - return "Stellt Funktionen zur Nutzung im Therapieplan-Unterformular für Einzelempfehlungen bereit"; - } + private final PersonPoolBasedPermissionEvaluator permissionEvaluator; - /** - * @deprecated - */ - @Override - public boolean isRelevantForDeletedProcedure() { - return false; - } + public EinzelempfehlungAnalyzer( + final IOnkostarApi onkostarApi, + final StudienService studienService, + final MolekulargenetikFormService molekulargenetikFormService, + final PersonPoolBasedPermissionEvaluator permissionEvaluator) { + this.onkostarApi = onkostarApi; + this.studienService = studienService; + this.molekulargenetikFormService = molekulargenetikFormService; + this.permissionEvaluator = permissionEvaluator; + } - @Override - public boolean isRelevantForAnalyzer(Procedure procedure, Disease disease) { - return false; - } + @Override + public String getDescription() { + return "Stellt Funktionen zur Nutzung im Therapieplan-Unterformular für Einzelempfehlungen bereit"; + } - @Override - public boolean isSynchronous() { - return false; - } + /** + * @deprecated + */ + @Override + public boolean isRelevantForDeletedProcedure() { + return false; + } - @Override - public AnalyzerRequirement getRequirement() { - return AnalyzerRequirement.PROCEDURE; - } + @Override + public boolean isRelevantForAnalyzer(Procedure procedure, Disease disease) { + return false; + } - public List getVariants(Map input) { - var procedureId = AnalyzerUtils.getRequiredId(input, "id"); + @Override + public boolean isSynchronous() { + return false; + } - if (procedureId.isEmpty()) { - return List.of(); - } + @Override + public AnalyzerRequirement getRequirement() { + return AnalyzerRequirement.PROCEDURE; + } - var procedure = onkostarApi.getProcedure(procedureId.get()); - if (null == procedure) { - return List.of(); - } + public List getVariants(Map input) { + var procedureId = AnalyzerUtils.getRequiredId(input, "id"); - if (permissionEvaluator.hasPermission(SecurityContextHolder.getContext().getAuthentication(), procedure, PermissionType.READ)) { - return molekulargenetikFormService.getVariants(procedure); - } else { - logger.error("Security: No permission to access procedure '{}'", procedure.getId()); - return List.of(); - } + if (procedureId.isEmpty()) { + return List.of(); } - /** - * Übergibt alle Studien, deren (Kurz-)Beschreibung oder NCT-Nummer den übergebenen Eingabewert q enthält - * - *

Wurde der Eingabewert nicht angegeben oder ist leer, werden alle Studien übergeben. - * - *

Beispiel zur Nutzung in einem Formularscript - * 

-     * executePluginMethod(
-     *   'TherapieplanAnalyzer',
-     *   'getStudien',
-     *   { q: 'NCT-12', inactive: true },
-     *   (response) => console.log(response),
-     *   false
-     * );
-     *
- * - * @param input Map mit Eingabewerten - * @return Liste mit Studien - */ - public List getStudien(Map input) { - var query = AnalyzerUtils.getRequiredValue(input, "q", String.class); - var inactive = AnalyzerUtils.getRequiredValue(input, "inactive", Boolean.class).orElse(false); - - if (query.isEmpty() || query.get().isBlank()) { - if (inactive) { - return studienService.findAll(); - } - return studienService.findActive(); - } - if (inactive) { - return studienService.findByQuery(query.get()); - } - return studienService.findActiveByQuery(query.get()); + var procedure = onkostarApi.getProcedure(procedureId.get()); + if (null == procedure) { + return List.of(); } + if (permissionEvaluator.hasPermission( + SecurityContextHolder.getContext().getAuthentication(), procedure, PermissionType.READ)) { + return molekulargenetikFormService.getVariants(procedure); + } else { + logger.error("Security: No permission to access procedure '{}'", procedure.getId()); + return List.of(); + } + } + + /** + * Übergibt alle Studien, deren (Kurz-)Beschreibung oder NCT-Nummer den übergebenen Eingabewert + * q enthält + * + *

Wurde der Eingabewert nicht angegeben oder ist leer, werden alle Studien übergeben. + * + *

Beispiel zur Nutzung in einem Formularscript + * + * 

+   * executePluginMethod(
+   *   'TherapieplanAnalyzer',
+   *   'getStudien',
+   *   { q: 'NCT-12', inactive: true },
+   *   (response) => console.log(response),
+   *   false
+   * );
+   *
+ * + * @param input Map mit Eingabewerten + * @return Liste mit Studien + */ + public List getStudien(Map input) { + var query = AnalyzerUtils.getRequiredValue(input, "q", String.class); + var inactive = AnalyzerUtils.getRequiredValue(input, "inactive", Boolean.class).orElse(false); + + if (query.isEmpty() || query.get().isBlank()) { + if (inactive) { + return studienService.findAll(); + } + return studienService.findActive(); + } + if (inactive) { + return studienService.findByQuery(query.get()); + } + return studienService.findActiveByQuery(query.get()); + } } -- cgit v1.2.3