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path: root/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb
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context:
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authorPaul-Christian Volkmer2024-09-21 22:10:24 +0200
committerPaul-Christian Volkmer2024-09-21 22:10:24 +0200
commitcc27edc544cec1b892e7c224aec9e6e42342aa39 (patch)
tree3036b92f84a707d769782d63c2b018166623abf5 /src/test/java/dev/dnpm/services/mtb
parent93215825f5c8aec0912d562b544f370cffe9cda7 (diff)
refactor: use package name following Java guidelines
Diffstat (limited to 'src/test/java/dev/dnpm/services/mtb')
-rw-r--r--src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/DefaultMtbServiceTest.java185
-rw-r--r--src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/MrMtbAnmeldungToProtocolMapperTest.java139
-rw-r--r--src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/OsTumorkonferenzToProtocolMapperTest.java47
-rw-r--r--src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/OsTumorkonferenzVarianteUkwToProtocolMapperTest.java47
4 files changed, 418 insertions, 0 deletions
diff --git a/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/DefaultMtbServiceTest.java b/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/DefaultMtbServiceTest.java
new file mode 100644
index 0000000..0919d89
--- /dev/null
+++ b/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/DefaultMtbServiceTest.java
@@ -0,0 +1,185 @@
+package dev.dnpm.services.mtb;
+
+import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi;
+import de.itc.onkostar.api.Item;
+import de.itc.onkostar.api.Procedure;
+import org.junit.jupiter.api.BeforeEach;
+import org.junit.jupiter.api.Test;
+import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith;
+import org.junit.jupiter.params.ParameterizedTest;
+import org.junit.jupiter.params.provider.MethodSource;
+import org.mockito.Mock;
+import org.mockito.junit.jupiter.MockitoExtension;
+
+import java.time.Instant;
+import java.util.*;
+
+import static org.assertj.core.api.Assertions.assertThat;
+
+@ExtendWith(MockitoExtension.class)
+class DefaultMtbServiceTest {
+
+ private IOnkostarApi onkostarApi;
+
+ private DefaultMtbService service;
+
+ @BeforeEach
+ void setup(
+ @Mock IOnkostarApi onkostarApi
+ ) {
+ this.onkostarApi = onkostarApi;
+ this.service = new DefaultMtbService(onkostarApi);
+ }
+
+ private static Set<Map.Entry<String, Class<? extends ProcedureToProtocolMapper>>> expectedMappings() {
+ return Map.ofEntries(
+ Map.entry("OS.Tumorkonferenz", OsTumorkonferenzToProtocolMapper.class),
+ Map.entry("OS.Tumorkonferenz.VarianteUKW", OsTumorkonferenzVarianteUkwToProtocolMapper.class),
+ Map.entry("MR.MTB_Anmeldung", MrMtbAnmeldungToProtocolMapper.class)
+ ).entrySet();
+ }
+
+ @ParameterizedTest
+ @MethodSource("expectedMappings")
+ void testShouldMapFormNameToMapper(Map.Entry<String, Class<?>> expectedMapping) {
+ var procedure = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure.setFormName(expectedMapping.getKey());
+
+ var actual = service.procedureToProtocolMapper(procedure);
+
+ assertThat(actual).isExactlyInstanceOf(expectedMapping.getValue());
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldReturnMtbProtocolForDefaultImplementation() {
+ var procedure1 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure1.setFormName("OS.Tumorkonferenz");
+ procedure1.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-01-01T00:00:00Z")));
+ procedure1.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test ok?"));
+ procedure1.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Rerun Test if not ok!"));
+
+ var procedures = List.of(
+ procedure1
+ );
+
+ var actual = service.getProtocol(procedures);
+
+ assertThat(actual).isEqualTo("Fragestellung:\nTest ok?\n\nEmpfehlung:\nRerun Test if not ok!");
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldReturnMtbProtocolForMultipleTK() {
+ var procedure1 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure1.setFormName("OS.Tumorkonferenz");
+ procedure1.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-02-01T00:00:00Z")));
+ procedure1.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test immer noch ok?"));
+ procedure1.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Do not rerun Test if ok!"));
+
+ var procedure2 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure2.setFormName("OS.Tumorkonferenz");
+ procedure2.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-01-01T00:00:00Z")));
+ procedure2.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test ok?"));
+ procedure2.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Rerun Test if not ok!"));
+
+ var procedures = List.of(
+ procedure1,
+ procedure2
+ );
+
+ var actual = service.getProtocol(procedures);
+
+ assertThat(actual).isEqualTo(
+ "Fragestellung:\nTest ok?\n\nEmpfehlung:\nRerun Test if not ok!\n\n" +
+ "Fragestellung:\nTest immer noch ok?\n\nEmpfehlung:\nDo not rerun Test if ok!"
+ );
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldReturnMtbProtocolForMultipleTKVarianteUKW() {
+ var procedure1 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure1.setFormName("OS.Tumorkonferenz.VarianteUKW");
+ procedure1.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-02-01T00:00:00Z")));
+ procedure1.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test immer noch ok?"));
+ procedure1.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Do not rerun Test if ok!"));
+
+ var procedure2 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure2.setFormName("OS.Tumorkonferenz.VarianteUKW");
+ procedure2.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-01-01T00:00:00Z")));
+ procedure2.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test ok?"));
+ procedure2.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Rerun Test if not ok!"));
+
+
+ var procedures = Arrays.asList(
+ procedure1,
+ procedure2
+ );
+
+ var actual = service.getProtocol(procedures);
+
+ assertThat(actual).isEqualTo(
+ "Fragestellung:\nTest ok?\n\nEmpfehlung:\nRerun Test if not ok!\n\n" +
+ "Fragestellung:\nTest immer noch ok?\n\nEmpfehlung:\nDo not rerun Test if ok!"
+ );
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldReturnDistinctProtocolEntries() {
+ var procedure1 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure1.setFormName("OS.Tumorkonferenz.VarianteUKW");
+ procedure1.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-02-01T00:00:00Z")));
+ procedure1.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test immer noch ok?"));
+ procedure1.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Do not rerun Test if ok!"));
+
+ var procedure2 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure2.setFormName("OS.Tumorkonferenz.VarianteUKW");
+ procedure2.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-02-01T00:00:00Z")));
+ procedure2.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test immer noch ok?"));
+ procedure2.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Do not rerun Test if ok!"));
+
+ var procedure3 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure3.setFormName("OS.Tumorkonferenz.VarianteUKW");
+ procedure3.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-01-01T00:00:00Z")));
+ procedure3.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test ok?"));
+ procedure3.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Rerun Test if not ok!"));
+
+
+ var procedures = Arrays.asList(
+ procedure1,
+ procedure2,
+ procedure3
+ );
+
+ var actual = service.getProtocol(procedures);
+
+ assertThat(actual).isEqualTo(
+ "Fragestellung:\nTest ok?\n\nEmpfehlung:\nRerun Test if not ok!\n\n" +
+ "Fragestellung:\nTest immer noch ok?\n\nEmpfehlung:\nDo not rerun Test if ok!"
+ );
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldReturnEmptyMtbProtocolForUnknownForm() {
+ var procedure1 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure1.setFormName("OS.Tumorkonferenz.Unbekannt");
+ procedure1.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-02-01T00:00:00Z")));
+ procedure1.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test immer noch ok?"));
+ procedure1.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Do not rerun Test if ok!"));
+
+ var procedure2 = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure2.setFormName("OS.Tumorkonferenz.Unbekannt");
+ procedure2.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-01-01T00:00:00Z")));
+ procedure2.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test ok?"));
+ procedure2.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Rerun Test if not ok!"));
+
+
+ var procedures = Arrays.asList(
+ procedure1,
+ procedure2
+ );
+
+ var actual = service.getProtocol(procedures);
+
+ assertThat(actual).isEmpty();
+ }
+
+}
diff --git a/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/MrMtbAnmeldungToProtocolMapperTest.java b/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/MrMtbAnmeldungToProtocolMapperTest.java
new file mode 100644
index 0000000..5253cfc
--- /dev/null
+++ b/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/MrMtbAnmeldungToProtocolMapperTest.java
@@ -0,0 +1,139 @@
+package dev.dnpm.services.mtb;
+
+import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi;
+import de.itc.onkostar.api.Item;
+import de.itc.onkostar.api.Procedure;
+import org.junit.jupiter.api.BeforeEach;
+import org.junit.jupiter.api.Test;
+import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith;
+import org.mockito.Mock;
+import org.mockito.junit.jupiter.MockitoExtension;
+
+import java.util.Set;
+
+import static org.assertj.core.api.Assertions.assertThat;
+import static org.mockito.ArgumentMatchers.anyInt;
+import static org.mockito.Mockito.doAnswer;
+
+@ExtendWith(MockitoExtension.class)
+class MrMtbAnmeldungToProtocolMapperTest {
+
+ private IOnkostarApi onkostarApi;
+
+ private MrMtbAnmeldungToProtocolMapper mapper;
+
+ @BeforeEach
+ void setup(
+ @Mock IOnkostarApi onkostarApi
+ ) {
+ this.onkostarApi = onkostarApi;
+ this.mapper = new MrMtbAnmeldungToProtocolMapper(onkostarApi);
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldMapCompletedForm() {
+ var anmeldung = new Procedure(onkostarApi);
+ anmeldung.setId(1);
+ anmeldung.setFormName("MR.MTB_Anmeldung");
+ anmeldung.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Frage?"));
+ anmeldung.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", 2));
+
+ var empfehlung = new Procedure(onkostarApi);
+ empfehlung.setId(2);
+ empfehlung.setFormName("MR.MTB_Empfehlung");
+
+ var einzelempfehlung1 = new Procedure(onkostarApi);
+ einzelempfehlung1.setId(10);
+ einzelempfehlung1.setFormName("MR.MTB_Einzelempfehlung");
+ einzelempfehlung1.setValue("Prioritaet", new Item("Empfehlungsprio", 1));
+ einzelempfehlung1.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Empfehlung1"));
+
+ var einzelempfehlung2 = new Procedure(onkostarApi);
+ einzelempfehlung2.setId(20);
+ einzelempfehlung2.setFormName("MR.MTB_Einzelempfehlung");
+ einzelempfehlung2.setValue("Prioritaet", new Item("Empfehlungsprio", 2));
+ einzelempfehlung2.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Empfehlung2"));
+
+ doAnswer(invocationOnMock -> {
+ var procedureId = invocationOnMock.getArgument(0, Integer.class);
+ if (2 == procedureId) {
+ return empfehlung;
+ } else if (10 == procedureId) {
+ return einzelempfehlung1;
+ } else if (20 == procedureId) {
+ return einzelempfehlung2;
+ }
+ return null;
+ }).when(onkostarApi).getProcedure(anyInt());
+
+ doAnswer(invocationOnMock -> {
+ var procedureId = invocationOnMock.getArgument(0, Integer.class);
+ if (2 == procedureId) {
+ return Set.of(einzelempfehlung1, einzelempfehlung2);
+ }
+ return null;
+ }).when(onkostarApi).getSubprocedures(anyInt());
+
+ var actual = this.mapper.apply(anmeldung);
+
+ assertThat(actual)
+ .isPresent()
+ .contains(
+ "Fragestellung:\nFrage?\n\n"
+ + "Empfehlung:\nEmpfehlung1\n\n"
+ + "Empfehlung:\nEmpfehlung2"
+ );
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldMapFormWithMissingEinzelempfehlungen() {
+ var anmeldung = new Procedure(onkostarApi);
+ anmeldung.setId(1);
+ anmeldung.setFormName("MR.MTB_Anmeldung");
+ anmeldung.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Frage?"));
+ anmeldung.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", 2));
+
+ var empfehlung = new Procedure(onkostarApi);
+ empfehlung.setId(2);
+ empfehlung.setFormName("MR.MTB_Empfehlung");
+
+ doAnswer(invocationOnMock -> {
+ var procedureId = invocationOnMock.getArgument(0, Integer.class);
+ if (2 == procedureId) {
+ return empfehlung;
+ }
+ return null;
+ }).when(onkostarApi).getProcedure(anyInt());
+
+ var actual = this.mapper.apply(anmeldung);
+
+ assertThat(actual)
+ .isPresent()
+ .contains("Fragestellung:\nFrage?");
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldMapFormWithMissingEmpfehlung() {
+ var anmeldung = new Procedure(onkostarApi);
+ anmeldung.setId(1);
+ anmeldung.setFormName("MR.MTB_Anmeldung");
+ anmeldung.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Frage?"));
+
+ var actual = this.mapper.apply(anmeldung);
+
+ assertThat(actual)
+ .isPresent()
+ .contains("Fragestellung:\nFrage?");
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldMapFormWithMissingFragestellungAndEmpfehlung() {
+ var anmeldung = new Procedure(onkostarApi);
+ anmeldung.setId(1);
+ anmeldung.setFormName("MR.MTB_Anmeldung");
+
+ var actual = this.mapper.apply(anmeldung);
+
+ assertThat(actual).isEmpty();
+ }
+}
diff --git a/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/OsTumorkonferenzToProtocolMapperTest.java b/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/OsTumorkonferenzToProtocolMapperTest.java
new file mode 100644
index 0000000..863ed55
--- /dev/null
+++ b/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/OsTumorkonferenzToProtocolMapperTest.java
@@ -0,0 +1,47 @@
+package dev.dnpm.services.mtb;
+
+import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi;
+import de.itc.onkostar.api.Item;
+import de.itc.onkostar.api.Procedure;
+import org.junit.jupiter.api.BeforeEach;
+import org.junit.jupiter.api.Test;
+import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith;
+import org.mockito.Mock;
+import org.mockito.junit.jupiter.MockitoExtension;
+
+import java.time.Instant;
+import java.util.Date;
+
+import static org.assertj.core.api.Assertions.assertThat;
+
+@ExtendWith(MockitoExtension.class)
+class OsTumorkonferenzToProtocolMapperTest {
+
+ private IOnkostarApi onkostarApi;
+
+ private OsTumorkonferenzToProtocolMapper mapper;
+
+ @BeforeEach
+ void setup(
+ @Mock IOnkostarApi onkostarApi
+ ) {
+ this.onkostarApi = onkostarApi;
+ this.mapper = new OsTumorkonferenzToProtocolMapper();
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldReturnMtbProtocolForDefaultImplementation() {
+ var procedure = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure.setFormName("OS.Tumorkonferenz");
+ procedure.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-01-01T00:00:00Z")));
+ procedure.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test ok?"));
+ procedure.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Rerun Test if not ok!"));
+
+ var actual = mapper.apply(procedure);
+
+ assertThat(actual)
+ .isPresent()
+ .contains("Fragestellung:\nTest ok?\n\nEmpfehlung:\nRerun Test if not ok!");
+ }
+
+}
diff --git a/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/OsTumorkonferenzVarianteUkwToProtocolMapperTest.java b/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/OsTumorkonferenzVarianteUkwToProtocolMapperTest.java
new file mode 100644
index 0000000..0768a2f
--- /dev/null
+++ b/src/test/java/dev/dnpm/services/mtb/OsTumorkonferenzVarianteUkwToProtocolMapperTest.java
@@ -0,0 +1,47 @@
+package dev.dnpm.services.mtb;
+
+import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi;
+import de.itc.onkostar.api.Item;
+import de.itc.onkostar.api.Procedure;
+import org.junit.jupiter.api.BeforeEach;
+import org.junit.jupiter.api.Test;
+import org.junit.jupiter.api.extension.ExtendWith;
+import org.mockito.Mock;
+import org.mockito.junit.jupiter.MockitoExtension;
+
+import java.time.Instant;
+import java.util.Date;
+
+import static org.assertj.core.api.Assertions.assertThat;
+
+@ExtendWith(MockitoExtension.class)
+class OsTumorkonferenzVarianteUkwToProtocolMapperTest {
+
+ private IOnkostarApi onkostarApi;
+
+ private OsTumorkonferenzVarianteUkwToProtocolMapper mapper;
+
+ @BeforeEach
+ void setup(
+ @Mock IOnkostarApi onkostarApi
+ ) {
+ this.onkostarApi = onkostarApi;
+ this.mapper = new OsTumorkonferenzVarianteUkwToProtocolMapper();
+ }
+
+ @Test
+ void testShouldReturnMtbProtocolForDefaultImplementation() {
+ var procedure = new Procedure(onkostarApi);
+ procedure.setFormName("OS.Tumorkonferenz.VarianteUKW");
+ procedure.setStartDate(Date.from(Instant.parse("2023-01-01T00:00:00Z")));
+ procedure.setValue("Fragestellung", new Item("Fragestellung", "Test ok?"));
+ procedure.setValue("Empfehlung", new Item("Empfehlung", "Rerun Test if not ok!"));
+
+ var actual = mapper.apply(procedure);
+
+ assertThat(actual)
+ .isPresent()
+ .contains("Fragestellung:\nTest ok?\n\nEmpfehlung:\nRerun Test if not ok!");
+ }
+
+}