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diff --git a/src/main/java/DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java b/src/main/java/DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java deleted file mode 100644 index 1724272..0000000 --- a/src/main/java/DNPM/analyzer/EinzelempfehlungAnalyzer.java +++ /dev/null @@ -1,134 +0,0 @@ -package DNPM.analyzer; - -import DNPM.dto.Studie; -import DNPM.dto.Variant; -import DNPM.security.PermissionType; -import DNPM.security.PersonPoolBasedPermissionEvaluator; -import DNPM.services.StudienService; -import DNPM.services.molekulargenetik.MolekulargenetikFormService; -import de.itc.onkostar.api.Disease; -import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi; -import de.itc.onkostar.api.Procedure; -import de.itc.onkostar.api.analysis.AnalyzerRequirement; -import org.slf4j.Logger; -import org.slf4j.LoggerFactory; -import org.springframework.security.core.context.SecurityContextHolder; -import org.springframework.stereotype.Component; - -import java.util.List; -import java.util.Map; - -/** - * Diese Klasse implementiert ein Plugin, welches Funktionen für DNPM UF Einzelempfehlung bereitstellt. - * - * @since 0.2.0 - */ -@Component -public class EinzelempfehlungAnalyzer extends BackendService { - - private final static Logger logger = LoggerFactory.getLogger(EinzelempfehlungAnalyzer.class); - - private final IOnkostarApi onkostarApi; - - private final MolekulargenetikFormService molekulargenetikFormService; - - private final StudienService studienService; - - private final PersonPoolBasedPermissionEvaluator permissionEvaluator; - - public EinzelempfehlungAnalyzer( - final IOnkostarApi onkostarApi, - final StudienService studienService, - final MolekulargenetikFormService molekulargenetikFormService, - final PersonPoolBasedPermissionEvaluator permissionEvaluator - ) { - this.onkostarApi = onkostarApi; - this.studienService = studienService; - this.molekulargenetikFormService = molekulargenetikFormService; - this.permissionEvaluator = permissionEvaluator; - } - - @Override - public String getDescription() { - return "Stellt Funktionen zur Nutzung im Therapieplan-Unterformular für Einzelempfehlungen bereit"; - } - - /** - * @deprecated - */ - @Override - public boolean isRelevantForDeletedProcedure() { - return false; - } - - @Override - public boolean isRelevantForAnalyzer(Procedure procedure, Disease disease) { - return false; - } - - @Override - public boolean isSynchronous() { - return false; - } - - @Override - public AnalyzerRequirement getRequirement() { - return AnalyzerRequirement.PROCEDURE; - } - - public List<Variant> getVariants(Map<String, Object> input) { - var procedureId = AnalyzerUtils.getRequiredId(input, "id"); - - if (procedureId.isEmpty()) { - return List.of(); - } - - var procedure = onkostarApi.getProcedure(procedureId.get()); - if (null == procedure) { - return List.of(); - } - - if (permissionEvaluator.hasPermission(SecurityContextHolder.getContext().getAuthentication(), procedure, PermissionType.READ)) { - return molekulargenetikFormService.getVariants(procedure); - } else { - logger.error("Security: No permission to access procedure '{}'", procedure.getId()); - return List.of(); - } - } - - /** - * Übergibt alle Studien, deren (Kurz-)Beschreibung oder NCT-Nummer den übergebenen Eingabewert <code>q</code> enthält - * - * <p>Wurde der Eingabewert nicht angegeben oder ist leer, werden alle Studien übergeben. - * - * <p>Beispiel zur Nutzung in einem Formularscript - * <pre> - * executePluginMethod( - * 'TherapieplanAnalyzer', - * 'getStudien', - * { q: 'NCT-12', inactive: true }, - * (response) => console.log(response), - * false - * ); - * </pre> - * - * @param input Map mit Eingabewerten - * @return Liste mit Studien - */ - public List<Studie> getStudien(Map<String, Object> input) { - var query = AnalyzerUtils.getRequiredValue(input, "q", String.class); - var inactive = AnalyzerUtils.getRequiredValue(input, "inactive", Boolean.class).orElse(false); - - if (query.isEmpty() || query.get().isBlank()) { - if (inactive) { - return studienService.findAll(); - } - return studienService.findActive(); - } - if (inactive) { - return studienService.findByQuery(query.get()); - } - return studienService.findActiveByQuery(query.get()); - } - -} |
