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diff --git a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/DefaultSystemtherapieService.java b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/DefaultSystemtherapieService.java deleted file mode 100644 index 578613f..0000000 --- a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/DefaultSystemtherapieService.java +++ /dev/null @@ -1,98 +0,0 @@ -package DNPM.services.systemtherapie; - -import DNPM.dto.EcogStatusWithDate; -import DNPM.services.SettingsService; -import de.itc.onkostar.api.IOnkostarApi; -import de.itc.onkostar.api.Patient; -import de.itc.onkostar.api.Procedure; - -import java.util.*; -import java.util.stream.Collectors; - -/** - * Standardimplementierung des Systemtherapieservices - * - * @since 0.2.0 - */ -public class DefaultSystemtherapieService implements SystemtherapieService { - - private static final String ECOG_FIELD = "ECOGvorTherapie"; - - private final IOnkostarApi onkostarApi; - - private final SettingsService settingsService; - - public DefaultSystemtherapieService(final IOnkostarApi onkostarApi, final SettingsService settingsService) { - this.onkostarApi = onkostarApi; - this.settingsService = settingsService; - } - - /** - * Ermittelt eine Zusammenfassung der systemischen Therapien für eine Erkrankung - * - * @param diseaseId Die ID der Erkrankung - * @return Zusammenfassung der systemischen Therapien - */ - @Override - public List<Map<String, String>> getSystemischeTherapienFromDiagnose(int diseaseId) { - List<Map<String, String>> result = new ArrayList<>(); - for (Procedure prozedur : onkostarApi.getProceduresForDiseaseByForm(diseaseId, getFormName())) { - prozedurToProzedurwerteMapper(prozedur).apply(prozedur).ifPresent(result::add); - } - return result; - } - - /** - * Übergibt aktuell immer den Mapper für das Formular "OS.Systemische Therapie", - * da beide bekannte Varianten damit gemappt werden können. - * - * @param procedure Die Prozedur für die ein Mapper erstellt werden soll - * @return Der Mapper für die Prozedur - */ - @Override - public ProzedurToProzedurwerteMapper prozedurToProzedurwerteMapper(Procedure procedure) { - return new OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper(); - } - - /** - * Ermittelt den letzten bekannten ECOG-Status aus allen Systemtherapieformularen des Patienten - * - * @param patient Der zu verwendende Patient - * @return Der ECOG-Status als String oder leeres Optional - */ - @Override - public Optional<String> latestEcogStatus(Patient patient) { - return ecogStatus(patient).stream() - .max(Comparator.comparing(EcogStatusWithDate::getDate)) - .map(EcogStatusWithDate::getStatus); - } - - /** - * Ermittelt jeden bekannten ECOG-Status aus allen Systemtherapieformularen des Patienten - * - * @param patient Der zu verwendende Patient - * @return Eine Liste mit Datum und ECOG-Status als String - */ - @Override - public List<EcogStatusWithDate> ecogStatus(Patient patient) { - return patient.getDiseases().stream() - .flatMap(disease -> onkostarApi.getProceduresForDiseaseByForm(disease.getId(), getFormName()).stream()) - .filter(procedure -> null != procedure.getStartDate()) - .sorted(Comparator.comparing(Procedure::getStartDate)) - .map(procedure -> { - try { - return new EcogStatusWithDate(procedure.getStartDate(), procedure.getValue(ECOG_FIELD).getString()); - } catch (IllegalArgumentException e) { - return null; - } - }) - .filter(Objects::nonNull) - .collect(Collectors.toList()); - } - - private String getFormName() { - return settingsService - .getSetting("systemtherapieform") - .orElse("OS.Systemische Therapie"); - } -} diff --git a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper.java b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper.java deleted file mode 100644 index f78dde9..0000000 --- a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper.java +++ /dev/null @@ -1,90 +0,0 @@ -package DNPM.services.systemtherapie; - -import com.fasterxml.jackson.core.JsonProcessingException; -import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper; -import de.itc.onkostar.api.Item; -import de.itc.onkostar.api.Procedure; -import de.ukw.ccc.onkostar.atccodes.AtcCode; -import org.slf4j.Logger; -import org.slf4j.LoggerFactory; - -import java.util.*; - -/** - * Implementierung zum Mappen des Formulars "OS.Systemische Therapie" auf die Prozedurwerte - * - * @since 0.2.0 - */ -public class OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper implements ProzedurToProzedurwerteMapper { - - private static final Logger logger = LoggerFactory.getLogger(OsSystemischeTherapieToProzedurwerteMapper.class); - - @Override - public Optional<Map<String, String>> apply(Procedure procedure) { - try { - return Optional.of(getProzedurwerte(procedure)); - } catch (Exception e) { - logger.error("Fehler beim Mappen der Prozedur auf Prozedurwerte", e); - return Optional.empty(); - } - } - - private static Map<String, String> getProzedurwerte(Procedure prozedur) { - List<String> wirkstoffListe = new ArrayList<>(); - // SubstanzenCodesListe enthält die Liste der SubstanzenCodes - List<Map<String, String>> substanzenCodesListe = new ArrayList<>(); - - // alle Werte der Prozedur auslesen - Map<String, Item> alleWerte = prozedur.getAllValues(); - // Prozedurwerte enthält nur die interessanten Werte - Map<String, String> prozedurwerte = new HashMap<>(); - // alle Werte durchgehen und die interessanten übernehmen - if (alleWerte.containsKey("Beendigung")) { - prozedurwerte.put("Beendigung", alleWerte.get("Beendigung").getValue()); - } - if (alleWerte.containsKey("Ergebnis")) { - prozedurwerte.put("Ergebnis", alleWerte.get("Ergebnis").getValue()); - } - if (alleWerte.containsKey("Beginn")) { - prozedurwerte.put("Beginn", alleWerte.get("Beginn").getString()); - } - if (alleWerte.containsKey("Ende")) { - prozedurwerte.put("Ende", alleWerte.get("Ende").getString()); - } - if (alleWerte.containsKey("SubstanzenList")) { - List<Map<String, String>> substanzList = alleWerte.get("SubstanzenList").getValue(); - for (var substanz : substanzList) { - var substanzCodes = getSubstanzCode(substanz); - substanzenCodesListe.add(substanzCodes); - wirkstoffListe.add(substanzCodes.get("substance")); - } - } - - prozedurwerte.put("Wirkstoffe", String.join(", ", wirkstoffListe)); - try { - ObjectMapper mapper = new ObjectMapper(); - prozedurwerte.put("WirkstoffCodes", mapper.writeValueAsString(substanzenCodesListe)); - } catch (JsonProcessingException e) { - logger.error("Kann 'WirkstoffCodes' nicht in JSON-String mappen", e); - } - - return prozedurwerte; - } - - private static Map<String, String> getSubstanzCode(Map<String, String> substanz) { - Map<String, String> substanzCode = new HashMap<>(); - if (substanz.containsKey("Substanz")) { - if (AtcCode.isAtcCode(substanz.get("Substanz"))) { - substanzCode.put("system", "ATC"); - } else { - substanzCode.put("system", "other"); - } - substanzCode.put("code", substanz.get("Substanz")); - - } - if (substanz.containsKey("Substanz_shortDescription")) { - substanzCode.put("substance", substanz.get("Substanz_shortDescription")); - } - return substanzCode; - } -} diff --git a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/ProzedurToProzedurwerteMapper.java b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/ProzedurToProzedurwerteMapper.java deleted file mode 100644 index f205554..0000000 --- a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/ProzedurToProzedurwerteMapper.java +++ /dev/null @@ -1,14 +0,0 @@ -package DNPM.services.systemtherapie; - -import de.itc.onkostar.api.Procedure; - -import java.util.Map; -import java.util.Optional; -import java.util.function.Function; - -/** - * Mapper um ein Systemtherapieformular in eine Optional-Map mit Prozedurwerten umzuwandeln - * - * @since 0.2.0 - */ -public interface ProzedurToProzedurwerteMapper extends Function<Procedure, Optional<Map<String, String>>> {} diff --git a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/SystemtherapieService.java b/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/SystemtherapieService.java deleted file mode 100644 index a7ac1bd..0000000 --- a/src/main/java/DNPM/services/systemtherapie/SystemtherapieService.java +++ /dev/null @@ -1,29 +0,0 @@ -package DNPM.services.systemtherapie; - -import DNPM.services.TherapieMitEcogService; -import de.itc.onkostar.api.Procedure; - -import java.util.List; -import java.util.Map; - -/** - * Service für Systemtherapieformulare - * - * @since 0.2.0 - */ -public interface SystemtherapieService extends TherapieMitEcogService { - /** - * Ermittelt eine Zusammenfassung der systemischen Therapien für eine Erkrankung - * @param diseaseId Die ID der Erkrankung - * @return Die Zusammenfassung der systemischen Therapien - */ - List<Map<String, String>> getSystemischeTherapienFromDiagnose(int diseaseId); - - /** - * Erstellt den Mapper for die Prozedur - * @param procedure Die Prozedur für die ein Mapper erstellt werden soll - * @return Der erstellte ProzedurToProzedurwerteMapper - */ - ProzedurToProzedurwerteMapper prozedurToProzedurwerteMapper(Procedure procedure); - -} |